Ribosome Maturation

Ribosomen katalysieren die Übersetzung von mRNA in Proteine. Dadurch spielen sie eine Schlüsselrolle bei der Genexpression, dem Zellwachstum und dem Fortschreiten des Zellzyklus. Ribosomen sind große Ribonukleo-Protein-Komplexe (RNP), die aus ribosomaler RNA (rRNA) und einer großen Anzahl (>50) von ribosomalen Proteinen (r-Proteinen) bestehen. In den letzten Jahren wurden detaillierte Erkenntnisse über die 3D-Organisation von rRNA und r-Proteinen in reifen Ribosomen gewonnen. Darüber hinaus wurde deutlich, dass ein erheblicher Teil des Genoms eines einzelligen Eukaryoten (Bäckerhefe S. cerevisiae) für Faktoren kodiert, die für die Herstellung von Ribosomen erforderlich sind. Anhand der Hefe als Modellsystem untersuchen wir mit verschiedenen in vivo und in vitro Ansätzen die Zusammenhänge zwischen wichtigen Prozessen in der eukaryotischen Ribosomenbiogenese, nämlich der RNA-Synthese, der RNA-Verarbeitung, der RNA-Faltung, dem RNP-Aufbau und dem intrazellulären Transport von RNP-Vorläufern.

Ausgewählte Publikationen

Linnemann, J., Pöll, G., Jakob, S., Ferreira-Cerca, S., Griesenbeck, J., Tschochner, H., and Milkereit, P. (2019). Impact of two neighbouring ribosomal protein clusters on biogenesis factor binding and assembly of yeast late small ribosomal subunit precursors. PloS One 14, e0203415.

Pöll, G., Müller, C., Bodden, M., Teubl, F., Eichner, N., Lehmann, G., Griesenbeck, J., Tschochner, H., and Milkereit, P. (2017). Structural transitions during large ribosomal subunit maturation analyzed by tethered nuclease structure probing in S. cerevisiae. PloS One 12, e0179405.

Ohmayer, U., Gil-Hernández, Á., Sauert, M., Martín-Marcos, P., Tamame, M., Tschochner, H., Griesenbeck, J., and Milkereit, P. (2015). Studies on the Coordination of Ribosomal Protein Assembly Events Involved in Processing and Stabilization of Yeast Early Large Ribosomal Subunit Precursors. PloS One 10, e0143768.

Ohmayer, U., Gamalinda, M., Sauert, M., Ossowski, J., Pöll, G., Linnemann, J., Hierlmeier, T., Perez-Fernandez, J., Kumcuoglu, B., Leger-Silvestre, I., Faubladier, M., Griesenbeck, J., Woolford, J., Tschochner, H., and Milkereit, P. (2013). Studies on the Assembly Characteristics of Large Subunit Ribosomal Proteins in S. cerevisae. PloS One 8, e68412.

Hierlmeier, T., Merl, J., Sauert, M., Perez-Fernandez, J., Schultz, P., Bruckmann, A., Hamperl, S., Ohmayer, U., Rachel, R., Jacob, A., Hergert, K., Deutzmann, R., Griesenbeck, J., Hurt, E., Milkereit, P., Baßler, J., and Tschochner, H. (2013). Rrp5p, Noc1p and Noc2p form a protein module which is part of early large ribosomal subunit precursors in S. cerevisiae. Nucleic Acids Res. 41, 1191–1210.

Jakob, S., Ohmayer, U., Neueder, A., Hierlmeier, T., Perez-Fernandez, J., Hochmuth, E., Deutzmann, R., Griesenbeck, J., Tschochner, H., Milkereit, P. (2012). Interrelationships between Yeast Ribosomal Protein Assembly Events and Transient Ribosome Biogenesis Factors Interactions in Early Pre-Ribosomes. PLoS ONE 7, e32552.

Ohmayer, U., Perez-Fernandez, J., Hierlmeier, T., Pöll, G., Williams, L., Griesenbeck, J., Tschochner, H., Milkereit, P. (2012). Local tertiary structure probing of ribonucleoprotein particles by nuclease fusion proteins. PLoS ONE 7, e42449.

Jakovljevic, J., Ohmayer, U., Gamalinda, M., Talkish, J., Alexander, L., Linnemann, J., Milkereit, P., and Woolford, J.L. (2012). Ribosomal proteins L7 and L8 function in concert with six A₃ assembly factors to propagate assembly of domains I and II of 25S rRNA in yeast 60S ribosomal subunits. RNA N. Y. N 18, 1805–1822.

A local role for the small ribosomal subunit primary binder rpS5 in final 18S rRNA processing in yeast.
Neueder A, Jakob S, Pöll G, Linnemann J, Deutzmann R, Tschochner H, Milkereit P. PLoS One. 2010 Apr 19;5(4):e10194.

Analysis of ribosome biogenesis factor-modules in yeast cells depleted from pre-ribosomes. Merl J, Jakob S, Ridinger K, Hierlmeier T, Deutzmann R, Milkereit P, Tschochner H. Nucleic Acids Res. 2010 May;38(9):3068-80. Epub 2010 Jan 25.

The Noc-domain containing C-terminus of Noc4p mediates both formation of the Noc4p-Nop14p submodule and its incorporation into the SSU processome. Kühn H, Hierlmeier T, Merl J, Jakob S, Aguissa-Touré AH, Milkereit P, Tschochner H. PLoS One. 2009 Dec 18;4(12):e8370.

rRNA maturation in yeast cells depleted of large ribosomal subunit proteins. Pöll G, Braun T, Jakovljevic J, Neueder A, Jakob S, Woolford JL Jr, Tschochner H, Milkereit P. PLoS One. 2009 Dec 11;4(12):e8249.

Analysis of the in vivo assembly pathway of eukaryotic 40S ribosomal proteins. Ferreira-Cerca S, Pöll G, Kühn H, Neueder A, Jakob S, Tschochner H, Milkereit P. Mol Cell. 2007 Nov 9;28(3):446-57.

Roles of eukaryotic ribosomal proteins in maturation and transport of pre-18S rRNA and ribosome function. Ferreira-Cerca S, Pöll G, Gleizes PE, Tschochner H, Milkereit P. Mol Cell. 2005 Oct 28;20(2):263-75.

The pre-ribosomal network.  Milkereit P, Kühn H, Gas N, Tschochner H. Nucleic Acids Res. 2003 Feb 1;31(3):799-804.

A Noc complex specifically involved in the formation and nuclear export of ribosomal 40 S subunits. Milkereit P, Strauss D, Bassler J, Gadal O, Kühn H, Schütz S, Gas N, Lechner J, Hurt E, Tschochner H. J Biol Chem. 2003 Feb 7;278(6):4072-81. Epub 2002 Nov 20.

Maturation and intranuclear transport of pre-ribosomes requires Noc proteins. Milkereit P, Gadal O, Podtelejnikov A, Trumtel S, Gas N, Petfalski E, Tollervey D, Mann M, Hurt E, Tschochner H. Cell. 2001 May 18;105(4):499-509.

Association of yeast RNA polymerase I with a nucleolar substructure active in rRNA synthesis and processing. Fath S, Milkereit P, Podtelejnikov AV, Bischler N, Schultz P, Bier M, Mann M, Tschochner H. J Cell Biol. 2000 May 1;149(3):575-90.

All relevant publications in PubMed.

• Juli 2011-Juni 2023

  DFG collaborative research Center SFB960 at the University of Regensburg: Ribosome formation: principles of RNP biogenesis and control of their function

  Project B1: Analyses of eukaryotic ribosome assembly