Strukturelle Bioinformatik

Prof. Dr. Till Rudack

E-Mail: till.rudackATur.de

Telefon: 0049-941-943-3048

Büro: WND E3_1.323

Willkommen bei der Strukturellen Bioinformatik!

Prof. Dr. Till Rudack ist zum 01.04.2023 auf die Professur für Strukturelle Bioinformatik berufen worden. Die Webseite der Gruppe befindet sich derzeit im Aufbau.

Hier finden Sie die englische Webseite.

Das übergeordnete Forschungsziel der Gruppe besteht darin, skalenübergreifende zeitaufgelöste atomare Einblicke in die Struktur und Dynamik molekularer Maschinen zu gewinnen. Die hieraus abgeleiteten Erkenntnisse wie molekulare Maschinen zelluläre Prozesse antreiben geben Einblicke in die Grundlagen des Lebens, die u. a. für das Verständnis von Krankheiten, die Entwicklung von Medikamenten, Therapie- und Diagnoseverfahren sowie dem gezielten Proteindesign genutzt werden. Um diese Einblicke zu erzielen, entwickeln und verwenden wir computer-gestützte Strategien, die Algorithmen der biomolekularen Simulationen, quantenchemischen Rechnungen und der künstlichen Intelligenz mit Daten aus biophysikalischen und biochemischen Experimenten kombinieren. Unsere Strategien sind auf nahezu alle molekularen Maschinen anwendbar.

Forschungsschwerpunkte:

Untersuchung molekularer Mechanismen onkologischer Zielstrukturen, z.B. dem Ras-Protein, bei dem bei etwa 20% aller onkologischen Erkrankungen eine Fehlfunktion vorliegt oder dem für Proteinrecycling verantwortliche Proteasome, das als Wirkstoffziel während der Chemotherapie angegriffen wird.
Erkenntnisse zur Umwandlung von Licht in chemische Energie während der Photosynthese, um langfristig widerstandsfähigere Pflanzen zu züchten, die mehr CO2 binden und so dem Klimawandel entgegenwirken.
Untersuchung von RNA-Protein-Komplexen
Entwicklung von hybriden quanten- und molekularmechanischen (QM/MM) Verfahren zur Berechnung physikalischer Eigenschaften von Proteinen. Diese Verfahren dienen dazu schnelle Prozesse mit hoher räumlicher und zeitlicher Auflösung zu simulieren und mit experimentellen Daten, z. B. aus der Spektroskopie, zu validieren.

Lehre

Wir sind immer auf der Suche nach motivierten Bachelor- und Masterstudenten. Bitte kontaktieren Sie Till Rudack, wenn Sie sich der Strukturelle Bioinformatik Gruppe anschließen wollen.

Lehrveranstaltungen im Sommersemester 23

54260 Blockkurs/Vorlesung: Einführung ins molekulare Modellieren 19.06-23.06 täglich von 10:00-17:00 Uhr (Anmeldung per E-Mail bis zum 12.06.23)
54261 Seminar: Methoden und Anwendungen der strukturellen Bioinformatik
54262 Seminar zu laufenden wissenschaftlichen Arbeiten der strukturellen Bioinformatik
54246 Laborpraktikum: Sequenz- und strukturbasierte Bioinformatik

Lehrveranstaltungen im Wintersemester 23/24

54133 Vorlesung: Statistik und Bioinformatik (gemeinsam mit Florian Hartig)
54134 Übung zur Vorlesung: Statistik und Bioinformatik (gemeinsam mit Florian Hartig)
54261 Seminar: Methoden und Anwendungen der strukturellen Bioinformatik
54262 Seminar zu laufenden wissenschaftlichen Arbeiten der strukturellen Bioinformatik
54246 Laborpraktikum: Sequenz- und strukturbasierte Bioinformatik

Lehr-Funktionen

Verantwortlicher für das Schwerpunktmodul Bioinformatik des Masters Biologie
Abnahme von Modulabschlussprüfungen

Sollten Sie Interesse an den Veranstaltungen haben wenden Sie sich bitte per E-Mail an Till Rudack. Weitere Informationen finden Sie in SPUR und GRIPS.